脱硫微生物可分为光合细菌和无色硫细菌两大类。光合细菌主要用于处理气体硫化物，其研究尚处于早期阶段。相比之下，无色硫细菌的研究更为活跃，已进入中试和生产性试验阶段，并取得了显著的效果。 光合细菌
光合细菌包括多种类型，如紫色硫细菌（Chromatiaceae）和绿色硫细菌（Chlorobiaceae）。其中，仅有某些特定品种能够代谢硫化物。此外，紫色无硫细菌（Rhodospirillaeceae）中也有少量物种能够耐受高浓度硫化物。
无色硫细菌
无色硫细菌主要是化能自养型，它们能够氧化各种形式的硫化物，如硫化氢、元素硫、硫代硫酸盐和连四硫酸盐，从而生成硫酸并从中获取能量。常见的无色硫细菌包括氧化硫硫杆菌（Thiobacillus thiooxidans）、排硫硫杆菌（Thiobacillus thioparus）、氧化亚铁硫杆菌（Thiobacillus ferrooxidans）以及脱氮硫杆菌（Thiobacillus denitrificans）。 