代谢网络

代谢网络
有关细胞的代谢网络可以分不同层次来讨论:基因组DNA层次)、代谢途径及生化反应网络(蛋白质层次)、代谢流(物流层次)、代谢生理(微生物细胞层次)等等。对蛋白质层次的代谢网络来说,一个代谢物分子就是一个节点,而节点之间的连结则是生化反应。大部分的分子只参加一种或两种反应,但少数分子参与许多反应,它们实际上就是代谢流的集散中心或通用代谢物(currency metabolites)。

基本介绍

生物界的一种无尺度网络

(1)细胞的代谢网络是生物界的一种无尺度网络
“网”最初是指用一组线(或绳)两两交替地[wǎn]成疙瘩(打“结”)而形成的多孔的捕鱼或捕兽器具,网上线的“结”就相当于网络结构中的“节点”。天然的网络结构大多是随机的,人造的网络结构大多是规则的。在随机的网络结构中,节点与其他节点的连结的数量呈正态分布;在规则的网络结构中,节点与其他节点的连结数量是固定的。以上两类网络中,节点与其他节点的连结的数量分布都有规则可循,因此是有尺度的网络。然而,用数学方法描绘互联网时,出乎意料地发现有些节点与大量的其他节点连结,形成一个个集散中心(称为集散节点),因而把互联网这样的网络称为无尺度网络(scale-free network)。