北京市环境保护局曾是负责北京市环境保护工作的市政府组成部门，2018年11月，组建北京市生态环境局，作为市政府组成部门。不再保留北京市环境保护局。[1]
机构职责
（一）贯彻落实国家关于环境保护方面的法律、法规、规章和政策；起草本市相关地方性法规草案、政府规章草案，拟订环境保护政策、规划并组织实施，建立健全环境保护制度；组织编制环境功能区划；拟订地方污染物排放标准和国家规定项目以外的地方环境质量标准；组织拟订并监督实施重点区域、重点流域污染防治规划和饮用水水源地环境保护规划。
（二）负责本市重大环境问题的统筹协调和监督管理。牵头组织协调重大环境污染事故和生态破坏事件的调查处理，参与突发环境事件的应急处置；协调推动与周边省区市区域、流域污染防治工作；统筹协调重点区域、流域的污染防治工作；协调解决区县之间的区域、流域环境污染纠纷。 （三）承担落实本市污染减排目标的责任。组织制定主要污染物排放总量控制计划并监督实施，实施排污许可证制度；督查、督办、核查有关部门、单位和各区县污染物减排任务完成情况；实施环境保护目标责任制，负责总量减排考核并公布考核结果。