关于亚种分化,学者们意见不一致。有学者将大短趾百灵(Calandrella brachydactyla)和红顶短趾百灵(Calandrella cinerea)作为同一个种,分为16个亚种或20个亚种(Meinertzhagen,1951;De-mcnt'ev and Gladkow,1954;Howard and Moore,1980);有的学者将分布于中国新疆北部和东北的种群归入Calandrella cinerea orientalis亚种,而将分布于中亚、哈萨克斯坦、阿富汗的种群归入红顶短趾百灵新疆亚种(Calandrella cinerea Iongipennis)(Sushkin,1925;Dement' ev and Gladkov,1954;Howard and Moore,1980)。也有学者认为Calandrella cinerea orientaILs亚种是红顶短趾百灵新疆亚种(Calandrella cinerea Iongipennis)的同物异名,将此亚种并入红顶短趾百灵新疆亚种(Calandrella cinerea Iongipennis)(Vaurie,1959)。
在种名的使用上,有的学者(Dement' ev and Gladkov,1954;Vaurie,1959;Walters Howardand Moore.1980,1959;郑作新,1976,1994;郑宝赉[lài]等,1985;蔡其侃,1988;赵正阶等,1988,2001;De schauensee,1984)使用红顶短趾百灵(Calandrella cinerea)种名;有的学者(Baker,1926;La Touch 1925-1930;Blackwelder,1907)使用大短趾百灵(Calandrella brachydactyla)种名。