上海出入境检验检疫局由原上海进出口商品检验局、上海动植物检疫局、上海卫生检疫局合并组建而成，是国家质量监督检验检疫总局设在上海口岸的直属机构，由国家质量监督检验检疫总局实施垂直领导。上海出入境检验检疫局拥有国内领先、门类齐全的检验检疫仪器设备，是一个技术力量雄厚、检测手段齐全的综合性检验检疫机构。
主要职能
1.贯彻执行出入境卫生检疫、动植物检疫和进出口商品检验法律、法规和政策规定的实施细则、办法及工作规程，负责所辖区域的出入境检验检疫、鉴定、认证和监督管理 行政执法工作。 2.负责实施出入境卫生检疫、传染病监测和卫生监督。负责口岸传染病的预防与控制工作，负责出入境人员的预防接种和传染病监测体检管理工作。 3.负责实施出入境动植物及其产品和其他检疫物的检验检疫与监督管理。负责动植物疫情监测、调查等工作，办理国家出入境检验检疫局授权的动植物检疫审批，实施动植物疫情的紧急预防措施。