《钦定藏内善后章程》，又称《钦定藏内善后章程二十九条》和《新订西藏章程二十九条》，是清朝治理西藏的重要依据。廓尔喀战争后，乾隆帝指示福康安等人“将来撤兵后，必当妥立章程，以 期永远遵循。”，八世达赖强白嘉措也表示：“将来立定章程，惟有同 驻藏大臣督率噶伦及番众等敬谨遵照，事事实力奉行，自必于藏地大有裨益，我亦受益无穷。” 签订经过
1791年，廓尔喀（今尼泊尔）因与西藏盐税银钱纠纷与白教活佛夏玛巴唆使，军队入侵西藏，意图抢掠遍布西藏各地的寺庙中的财富。当时，西藏请求清政府派兵支援。 1792年（清乾隆五十七年），乾隆命清朝大将军福康安同参赞大臣海兰察率领清兵支援当地藏兵，将廓尔喀军队驱返喜马拉雅山南麓，甚至还反攻至廓尔喀首都－阳布外二十公里的热锁桥，迫使廓尔喀向清朝五年朝贡一次。驱逐廓尔喀军队之后，清政府以完善西藏行政为理由，订立了治理西藏的多项章程，要求以“金瓶掣签”认定达赖喇嘛、班禅喇嘛与各大呼图克图的转世灵童。 1793年，上述章程的部分条款汇编成《 新订西藏章程二十九条》，并翻译成藏文。章程对西藏的宗教事务、外事、军事、行政和司法做出了详细的规定。章程的第一条规定，认定活佛转世实行金瓶掣签制度。 