乔卢特卡的历史可以追溯到1535年,当时Chorotega原住民居住在该地区。西班牙征服者Cristobál de la Cueva上尉于1541年在此地建立了名为Villa de Xerez de la Frontera de Choluteca的城镇。该城镇的建立是西班牙人在其领土上战略位置建立殖民地的一部分,目的是从原住民手中占领和控制土地 。Villa de Xerez de la Frontera成为了与危地马拉和尼加拉瓜的通信中心。乔卢特卡地区因其丰富的矿产和肥沃的农业土地而成为西班牙在洪都拉斯最富有的殖民地之一。1845年10月1日,洪都拉斯总统Coronado Chávez领导下的国 家国会正式将该城市命名为“乔卢特卡”。关于乔卢特卡的建立年份有多种说法,但现代历史学家Marxis Lenin Hernández认为需要进一步调查以确定其真实起源。1998年,乔卢特卡在飓风米奇的影响下遭受了严重破坏,但在慈善组织Solar net Village的帮助下,该市得以重建。