乌本杜在殖民时期由刚果上游至非洲大湖地区铁路公司(Compagnie du chemin de fer du Congo supérieur aux Grands Lacs africains)或CFL(1902-1960)建造和运营,其铁路和河轮服务连接了基桑加尼与卡坦加(Katanga)。1951年,凯瑟琳·赫本、亨弗莱·鲍嘉特以及电影《非洲皇后号》的剧组乘火车抵达乌本杜,在丛林中进行拍摄。在那些日子里,这个城镇被描述为一个“漂亮的殖民地前哨”。然而,该地区在第二次刚果战争期间经历了一些最严重的战斗,造成了严重的破坏。