清光绪三十三年(1907年),马驹桥地区设马驹桥乡。民国三十七年(1948年)12月,通县解放,属通县第七区。1958年9月,成立马驹桥人民公社。1983年12月,公社改乡。1990年2月,乡改镇。2001年12月,大杜社镇并入。截止2020年11月1日零时,马驹桥镇常住人口为175794人。截至2019年10月,马驹桥镇下辖8个社区45个行政村,镇政府驻马驹桥工业区东路2号。
2022年,马驹桥镇工业总产值达到94.19亿元,与去年基本持平。完成固定资产投资185.76亿元,同比增长39%;完成建安投资90.9亿元,同比增长137%。2023年,马驹桥镇固定资产投资任务目标为212.02亿元,占城市副中心和经开区千亿投资项目比重均超过20%。2023年上半年,预计全镇完成固定资产投资95.45亿元,同比增长58.5%,完成全年进 度45%。[1][2] 历史沿革
1990年2月,马驹桥乡改镇。