横滨足球俱乐部于1999年成立,当时横滨市两大球会:横滨飞翼和横滨水手合并后的第二年,一些横滨飞翼的球迷不认为自己应该支持合并后的横滨水手,因为实际上飞翼已经解散,和横滨水手是横滨飞翼的同市死敌。所以,他们向公众募捐,与国际管理集团结盟,和集合横滨飞翼的球迷,成立了横滨Fulie体育会(Yokohama Fulie Sports Club)。然后他们仿效巴塞罗那采用的社会学模式,在Fulie体育会下成立了横滨FC。这是日本首间由球迷拥有和经营的球会。 球队历史
成立后的首季(即1999年),横滨足球俱乐部聘请了前西德国家足球队球星皮埃尔·列巴斯基成为经理。而奥寺康彦则为成首任主席。奥寺康彦是首位于欧洲职业联赛效力的日本球员。他们首季只能获准于日本足球联赛角逐,未能直接于顶级联赛角逐。他们于日本足球联赛连续夺得两季冠军后,获升级至日本职业足球乙级联赛。 他们于日本联业足球乙级联赛角逐了6个赛季,在2001年至2005年都是中游分子。不过,他们于2006年赢得乙级联赛冠军,获得直接升班至日本职业足球联赛的资格。在2007年,即球会成立的九年后,他们首次于日本联业足球联赛亮相。 2020年12月,横滨FC官方宣布,球队签下了千叶市原前锋克莱伯。[1]12月,横滨FC官方宣布,球队买断了租借在队中的清水心跳门将六反勇治。[2]12月21日,横滨FC官方宣布,球队已经与主帅下平隆宏完成续约。[3]