结节龙科是由奥塞内尔·查利斯·马什(Othniel Charles Marsh)在1890年所建立,以包含前一年命名的结节龙。结节龙科演化支由保罗·塞里诺(Paul Sereno)在1998年定义为:在甲龙亚目中,所有亲缘关系接近胄甲龙,而离甲龙较远的物种,这个定义由Vickaryous、Maryanska、以及大卫·威显穆沛(David B. Weishampel)等人的2004年研究中所沿用。Vickaryous等人认为节结龙科有两属应为未确定位置属:厚甲龙、活堡龙,并认为本科中最原始的物种为雪松甲龙。