染色质增加

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染色质增加是染色质X染色体发生X染色体失活，但是Xp基因有30%表现为逃逸，而Xq仅不到3%。为了研究X染色体基因失活和表达逃逸发生和维持的分子机制，比较了Xq和XpDNA序列的RNA模拟结合强度。

染色质增加简介

X染色体发生X染色体失活，但是Xp基因有30%表现为逃逸，而Xq仅不到3%。为了研究X染色体基因失活和表达逃逸发生和维持的分子机制，比较了Xq和XpDNA序列的RNA模拟结合强度。X染色体的核苷[gān]酸序列被分为50kb一段，对每一段DNA做7硷[jiǎn]基（7nt）字符串组合分析(共有47=16384种组合)，记录每段50kbDNA中每种7nt字符串的频率。选择生发中心B细胞中的120个高表达基因，计算这些基因的内含子7nt字符串的出现频率，称为intron7nt，以此作为RNAs（RNA群，模拟细胞中RNA在小片段的总和）。已知一段DNA序列的7nt频率值和intron7nt，即可以计算该DNA段与intron7nt（RNAs）的结合强度。每段50kbDNA与intron7nt的结合强度取决于该DNA段与intron7nt互补核苷酸的频率，互补的核苷酸序列越多，结合强度就越大。

例

DNA段与intron7nt的模拟结合强度称为RNA结合强度，试图模拟该段DNA可以结合的RNA小片段的总量。之所以采用7nt字符串组合分析是考虑到连续7个核苷酸互补则可以形成相对稳定的结合。本研究有3点发现：1）Xp各DNA段的RNA结合强度均值显著大于Xq(P<0.001)；2）Xp上高结合RNA的DNA段数目显著高于Xq(P<0.001);3)RNA高结合DNA段形成的簇与X染色体基因表达逃逸区关联。有证据表明RNA可以通过改变染色质构象活化基因并且该作用具有普遍意义：如RNA增加染色质对DNaseⅠ消化的敏感性，互补RNA-DNA的亲和性高于互补DNA-DNA，细胞中有丰富的非编码RNA和非编码DNA等。本研究中的发现结合RNA活化基因的观点，提示：Xp逃逸失活基因的数目多于Xq可能与前者的RNA结合强度大于后者有关。