染色体是基因的载体，基因在染色体上有自己的固定位置，这个位置叫基因座。[1]
当统计多个基因座时，常需分析两个基因座之间是否有关联，若两个基因座之间是独立无关的，可以将两个基因座的有关数据（如基因型的概率）相乘，称为乘积定理（productrole），否则不能应用此定理。亲权鉴定中，在将不同基因座的亲权指数相乘时，基因座间也不能有连锁。因此，基因座间的关联分析在DNA数据处理中很重要。一般位于不同染色体的基因座，或者虽在同一染色体，但相距很远，基因座间都是随机无关的、独立的。出于惯例，基因座间无相关性又常称为连锁平衡（linkage equilibrium，LE），尽管有时并不是在一条染色体的连锁。[2] 基本介绍
基因座是染色体的某种特定部位，既可以是一个基因，也可以是一部分基因，或者是一部分DNA序列。基因座与位点（site）不同，后者是一个顺反子内部的突变位置，可以小到一个核苷酸对。基因座的划分依据是在相同的基因座上的基因就是等位基因，在一些基因座上的等位基因具有个体特异性，可以确定个体身份。基因上的基因可以发生不同的变化。 基因座是染色体上的固定部位，编码在相同基因座上的DNA被称为等位基因。一些基因座上的等位基因具有明显的个体差异，因此它们就像指纹一样可以确定一个人的身份。