厦门珍稀海洋物种国家级自然保护区位于福建省厦门市海域，总面积33088公顷。2000年4月4日经国务院办公厅正式批准设立，该保护区是在厦门市政府1991年批准建立的厦门文昌鱼保护区、福建省政府1995年批准设立的白鹭保护区和1997年批准设立的中华白海豚保护区基础上合并建立的。为保护珍稀海洋物种设立的国家级自然保护区，保护的主要物种有：文昌鱼、中华白海豚和各种白鹭等。 历史沿革
1991年，厦门文昌鱼保护区经厦门市政批准建立。
1995年，白鹭保护区经福建省政府批准设立。
1997年，中华白海豚保护区设立。