《瘟疫论》（又称《温疫论》）是中医温病学发展史上的标志性著作，明代医学家吴 又可（吴有性）于崇祯十五年壬午（1642年）撰著。该书分为上下两卷，补遗一卷，是中国第一部系统研究急性传染病（温疫病）治法的专著。全书主要阐述瘟疫的病因、病机、证候及治疗，并从多个方面论述温疫与伤寒的不同。吴又可在《瘟疫论》中首次将外科感染疫病与传染病病因划入同一范畴，并建立了以机体抗病功能不良、感染戾气为发病原因的新观点。此外，吴又可还创立了“戾气”病因学说，强调了温疫与伤寒的完全不同。 吴又可在《瘟疫论》中创立了表里九传辩证论治思维模式，并创制了治疗温疫的有效方剂，如达原饮等。该书对后世温病学的形成与发展产生了深远影响。现存主要版本有清初刻本、四库全书本等，其中四库全书本较为珍贵。 作品原文
温疫论原序
昔仲景立《伤寒论》，其始自太阳，传至阳明，以至少阳，次传三阴，盖为正伤寒设也。嗣后论者纷纷，皆以正伤寒为辞，其于温疫之证甚略。是以医者，所记所诵，连篇累牍[dú]，俱系正伤寒。迨[dài]夫临症所见，悉见温疫，求其所谓正伤寒者，百无一二。予即按诸书，咸以为春、夏、秋所发，皆属温病，而伤寒必在冬时。则历年较之，温疫四时皆有，而真正伤寒，每在严寒。虽有头疼、身痛、恶寒、无汗、发热，总之谓太阳证。至六七日失治，未常传经。每用发散之剂，一汗即解。间有不药亦自愈者，并未常因失汗，以致发黄、谵[zhān]语、狂乱、胎刺等症。此皆感冒肤浅之病，非真伤寒也。伤寒、感冒，均系风寒，不无轻重之殊，究竟感冒俱多，伤寒希有。况温疫与伤寒，感受有霄壤之隔。今鹿马攸[yōu]分，益见伤寒世所绝少。仲景以伤寒为急病，仓卒失治，多致伤生，因立论以济天下万世，用心可谓仁矣。然伤寒与温疫皆急病也，以病之少者，尚谆谆以告世，况温疫多于伤寒百倍，安忍置之勿论?或谓温疫一证，仲景原别 有方论，历年既久，兵火湮没，即《伤寒论》称散亡之余，王叔和补方造论，辑成全书。则温疫之论，未必不由散亡也明矣。崇祯辛巳，疫气流行，感者甚多，于五六月益甚，或合门传染。其于始发之时，每见时师误以正伤寒法治之，未有不殆[dài]者。或病家误听七日当自愈，不尔，十四日必瘳[chōu]，因而失治。尽有不及期而死者;亦有治之太晚服药不及而死者;或妄投药剂攻补失序而死者。或遇医家见解不到，心疑胆怯，以急病用缓药，虽不即受其害，究迁延而致死，比比皆是。感邪之轻者，有获侥幸;感邪之重者，而加以失治，枉死不可胜计。嗟乎!守古法则不合今病，舍今病而别搜古书，斯投剂不效，医者仿徨无措，病者日近危笃。病愈急，投医愈乱。不死于病，乃死于医;不死于医，乃死于古册之遗忘也。吁!千载以来，何生民之不幸如此。余虽孤陋，静心穷理，格其所感之气、所入之门、所抵之处，与夫传变之体，并平日所用历应验方法，详述于下，以俟高明者正之。