蛙壶菌（学名：Batrachochytrium dendrobatidis）是一种壶菌门真菌，可以引起两栖类的壶菌病。它们最初是于1998年发现，在其后的十年内，造成了大量两栖类的死亡，引发多个物种灭绝，是为全新世灭绝事件之一。 分类
一些两栖类物种具有天生的免疫能力。就算一些患上壶菌病的物种，也能够生存下来，显示出演化性选择的痕迹或等位基因。不过另一个解释却指一些蛙壶菌的形态并非真正的病原体。 最初将它们分类在壶菌门下是基于孢子的超显微结构，DNA分析也证实了这个观点。 最新的研究表明，Batrachochytrium属还有另一个物种 Batrachochytrium salamandrivorans同样能引起壶菌病，导致火蝾螈的死亡。