基因预测是生物信息学的一个重要分支，它涉及使用生物学实验或计算机等手段识别DNA序列上的具有生物学特征的片段，主要目标是蛋白质编码基因，同时也包括RNA基因和调控因子等其他具有一定生物学功能的因子。基因预测是基因组研究的基础，对于理解生物体的遗传信息和功能至关重要。 基因预测方法
基因预测的过程包括在核酸序列中寻找基因，确定基因的位置和功能位点的位置，以及标记已知的序列模式等。随着人类基因组信息的积累，基于计算机算法的基因预测得到了长足的发展，成为了基因识别的主要手段。 间接识别法
间接识别法（Extrinsic Approach）利用已知的mRNA或蛋白质序列作为线索，在DNA序列中搜寻对应的片段。BLAST是目前广泛使用的间接识别法软件之一。然而，由于测定mRNA或蛋白质序列的成本高昂，且在复杂生物体中，基因的表达具有时空特异性，这种方法面临着一定的局限性。尽管如此，对于一些常见的实验生物，如老鼠和酵母菌，已经建立了大量的转录和蛋白质序列数据库，例如RefSeq数据库和Ensembl数据库。