中日甲午海战，清政府一败涂地，签订丧权辱国的《马关条约》，台湾沦陷于日本之手。林尔康“不耻左衽[rèn]”，再也不想在日本人的统治下苟延残喘般地生活，遂举家搬迁至厦门，终日为国忧心，不幸病故，终年28岁。 家族
其高祖父林应寅于清乾隆四十三年(1778年)东渡台湾淡水新庄，以教书为生，为“台湾板桥林”的始迁祖。曾祖父叫林平侯，经营盐业发财，捐官广西柳州知府，告老回台湾后，广买从淡水到宜兰的大片土地，年收租谷达数万石。其子林国华于清咸丰三年(1853年)迁台北板桥，开发板桥一带的荒山野岭，遂成巨富，大造园林，后称“林本源花园”。林国华生二子，长林维让，次林维源。林维让便是林尔康的父亲。捐清廷军饷2万两银子，奖“三品衔”。至林尔康兄弟，已历五世，凡二百多年，聚族而居，称台湾板桥林氏，被誉称为“台湾首富”。