1963年,在印尼-马来西亚对峙期间,布鲁内苏丹国对马来西亚的形成持模棱两可的态度。1964年4月,据报道发现了一份文件,证明布鲁内贵族与马来西亚有联系,在冲突中会支持马来西亚的形成,并加入马来西亚。1964年4月24日,地区军事指挥官穆拉瓦尔曼的领导人,准将苏哈尔乔下令逮捕并杀害布鲁内贵族。1964年7月2日,中尉B. Simatupang和上尉Buntaran受到布鲁内苏丹的热情接待。到了7月3日,Brawijaya 517部队的单位侵入了宫殿,宫殿被烧毁和洗劫,皇室成员被杀害。根据Burhan Djabier在1991年的书《东加里曼丹:商业贵族的衰落》中的说法,中央TNI领导层没有采取行动或替换他,因为准将苏哈尔乔是一个知名的左翼分子,政治上有联系。大多数左翼分子和印尼共产党(PKI)对皇室持敌对态度,这与东苏门答腊革命有相似之处。这也是苏丹国的立场,据Dato' Seri Pangeran Sanusi Hussin所说,PKI负责烧毁皇宫和种族清洗。幸存的皇室成员逃离并成为马来西亚公民。2017年,皇室宣布他们正在办理成为印尼公 民的手续。